纳豆激酶可直接作用于由血小板凝结形成的血栓；针对纤维蛋白形成的网状、絮状的难溶血栓主要有两种溶解途径：一种是直接与血纤蛋白反应溶解血栓，另一种是以催化剂的形式参与溶栓，通过促进体内t-PA (人组织型纤溶酶原激活剂)增多，激活体内自身的纤维蛋白酶原转化为纤维蛋白溶酶，进而溶解血栓，达到全面、彻底的溶栓效果。另外，红曲中的洛伐他汀抑制胆固醇合成过程中的限速酶羟甲戊二酰辅酶A还原酶，使胆固醇的合成减少，可有效防止血栓的形成，从而使血胆固醇和低密度脂蛋白胆固醇水平降低，由此对动脉粥样硬化和冠心病的防治产生作用。