下午三点以后不能艾灸的原因主要有以下几点：
1、根据阴阳五行理论，下午三点以后属阴，而艾灸也是阳性，部分患者上午艾灸可能会更好，但部分患者上午艾灸可能不起作用，甚至有些患者下午艾灸效果更佳。
2、从患者身体状态看，下午三点以后，人体开始进入晚上之前的状态，此时阳气逐渐衰减，进行艾灸可能会适得其反，使得阳气进一步耗散。
3、考虑到艾灸的疗效影响因素，包括患者疾病严重程度、艾灸疗程及医生操作的准确性等，需要医生结合患者具体情况进行调整。